Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CMPK1P30085 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms