Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GIMD1P0DJR0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GIMD1P0DJR0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms