Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PF4P02776 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PF4P02776 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PF4P02776 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PF4P02776 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PF4P02776 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PF4P02776 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PF4P02776 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PF4P02776 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PF4P02776 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PF4P02776 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PF4P02776 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PF4P02776 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PF4P02776 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PF4P02776 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PF4P02776 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PF4P02776 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PF4P02776 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PF4P02776 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PF4P02776 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PF4P02776 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PF4P02776 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PF4P02776 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PF4P02776 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PF4P02776 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PF4P02776 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PF4P02776 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PF4P02776 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PF4P02776 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PF4P02776 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PF4P02776 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PF4P02776 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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