Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KIAA0556O60303 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KIAA0556O60303 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms