Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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