Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERVV-1B6SEH8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERVV-1B6SEH8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms