Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PALM3A6NDB9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms