Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms