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Protein–RNA interactions for Protein: Q15843
NEDD8, NEDD8, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
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Ensembl Transcript ID
Length
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Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
NEDD8
Q15843
RNU6-788P-201
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NEDD8
Q15843
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BASIC
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□□□□□ -3.07
NEDD8
Q15843
AC110620.1-201
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228 nt
BASIC
-4.15
□□□□□ -3.07
NEDD8
Q15843
RNU6-539P-201
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103 nt
BASIC
-4.15
□□□□□ -3.07
NEDD8
Q15843
RNU6ATAC17P-201
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71 nt
BASIC
-4.16
□□□□□ -3.08
NEDD8
Q15843
MIR494-201
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81 nt
BASIC
-4.17
□□□□□ -3.08
NEDD8
Q15843
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□□□□□ -3.08
NEDD8
Q15843
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□□□□□ -3.08
NEDD8
Q15843
RNU6-1117P-201
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□□□□□ -3.08
NEDD8
Q15843
Y_RNA.520-201
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BASIC
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□□□□□ -3.08
NEDD8
Q15843
MIR4679-1-201
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-4.19
□□□□□ -3.08
NEDD8
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□□□□□ -3.08
NEDD8
Q15843
MIR450A2-201
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□□□□□ -3.08
NEDD8
Q15843
MIR548AL-201
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□□□□□ -3.08
NEDD8
Q15843
RNU6-776P-201
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□□□□□ -3.09
NEDD8
Q15843
RNU6-1022P-201
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□□□□□ -3.09
NEDD8
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NEDD8
Q15843
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□□□□□ -3.09
NEDD8
Q15843
MIR545-201
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BASIC
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□□□□□ -3.09
NEDD8
Q15843
RNU6-446P-201
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□□□□□ -3.1
NEDD8
Q15843
RNU6-209P-201
ENST00000384118
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BASIC
-4.29
□□□□□ -3.1
NEDD8
Q15843
Y_RNA.345-201
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BASIC
-4.31
□□□□□ -3.1
NEDD8
Q15843
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BASIC
-4.31
□□□□□ -3.1
NEDD8
Q15843
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BASIC
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NEDD8
Q15843
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□□□□□ -3.1
NEDD8
Q15843
RNU6-1204P-201
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BASIC
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□□□□□ -3.11
NEDD8
Q15843
AC090425.1-201
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BASIC
-4.36
□□□□□ -3.11
NEDD8
Q15843
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BASIC
-4.37
□□□□□ -3.11
NEDD8
Q15843
RNU6-422P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -3.11
NEDD8
Q15843
RNY4P30-201
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BASIC
-4.37
□□□□□ -3.11
NEDD8
Q15843
RNU6-808P-201
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BASIC
-4.39
□□□□□ -3.11
NEDD8
Q15843
AC114801.3-201
ENST00000510231
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BASIC
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□□□□□ -3.11
NEDD8
Q15843
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BASIC
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□□□□□ -3.11
NEDD8
Q15843
RNU6-215P-201
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102 nt
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NEDD8
Q15843
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NEDD8
Q15843
RNU6-406P-201
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□□□□□ -3.11
NEDD8
Q15843
RNU6-919P-201
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BASIC
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□□□□□ -3.12
NEDD8
Q15843
RNU6-1043P-201
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□□□□□ -3.12
NEDD8
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BASIC
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□□□□□ -3.12
NEDD8
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NEDD8
Q15843
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BASIC
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NEDD8
Q15843
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NEDD8
Q15843
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BASIC
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NEDD8
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BASIC
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NEDD8
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NEDD8
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NEDD8
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NEDD8
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NEDD8
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NEDD8
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NEDD8
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NEDD8
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NEDD8
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NEDD8
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NEDD8
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Q15843
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NEDD8
Q15843
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Q15843
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Q15843
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NEDD8
Q15843
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NEDD8
Q15843
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NEDD8
Q15843
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NEDD8
Q15843
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NEDD8
Q15843
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BASIC
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NEDD8
Q15843
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NEDD8
Q15843
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NEDD8
Q15843
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NEDD8
Q15843
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□□□□□ -3.18
NEDD8
Q15843
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□□□□□ -3.19
NEDD8
Q15843
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BASIC
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□□□□□ -3.19
NEDD8
Q15843
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BASIC
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NEDD8
Q15843
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NEDD8
Q15843
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BASIC
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NEDD8
Q15843
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NEDD8
Q15843
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□□□□□ -3.2
NEDD8
Q15843
RNU6-753P-201
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BASIC
-4.92
□□□□□ -3.2
NEDD8
Q15843
Y_RNA.388-201
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NEDD8
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-4.92
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NEDD8
Q15843
MIR3668-201
ENST00000582138
75 nt
BASIC
-4.93
□□□□□ -3.2
NEDD8
Q15843
MIR548F3-201
ENST00000408509
87 nt
BASIC
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□□□□□ -3.2
NEDD8
Q15843
RNU6-930P-201
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100 nt
BASIC
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NEDD8
Q15843
snosnR66.1-201
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NEDD8
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RNU6-936P-201
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Q15843
MIR3671-201
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NEDD8
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BASIC
-5.17
□□□□□ -3.24
NEDD8
Q15843
RNA5SP170-201
ENST00000517150
101 nt
BASIC
-5.17
□□□□□ -3.24
NEDD8
Q15843
RNU6-1298P-201
ENST00000362456
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BASIC
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Q15843
AC125388.1-201
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BASIC
-5.19
□□□□□ -3.24
NEDD8
Q15843
RNU6-620P-201
ENST00000384017
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BASIC
-5.2
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NEDD8
Q15843
RNU6-1275P-201
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BASIC
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□□□□□ -3.25
NEDD8
Q15843
TRAJ42-201
ENST00000390495
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-5.24
□□□□□ -3.25
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