Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PTPRBP23467 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PTPRBP23467 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
PTPRBP23467 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
PTPRBP23467 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PTPRBP23467 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PTPRBP23467 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PTPRBP23467 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
PTPRBP23467 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PTPRBP23467 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PTPRBP23467 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PTPRBP23467 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PTPRBP23467 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PTPRBP23467 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
PTPRBP23467 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
PTPRBP23467 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PTPRBP23467 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PTPRBP23467 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PTPRBP23467 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PTPRBP23467 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PTPRBP23467 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
PTPRBP23467 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
PTPRBP23467 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
PTPRBP23467 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
PTPRBP23467 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
PTPRBP23467 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
PTPRBP23467 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
PTPRBP23467 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
PTPRBP23467 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
PTPRBP23467 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
PTPRBP23467 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.91
PTPRBP23467 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PTPRBP23467 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PTPRBP23467 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
PTPRBP23467 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
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PTPRBP23467 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
PTPRBP23467 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
PTPRBP23467 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
PTPRBP23467 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PTPRBP23467 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
PTPRBP23467 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
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PTPRBP23467 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
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PTPRBP23467 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
PTPRBP23467 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
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PTPRBP23467 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
PTPRBP23467 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
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PTPRBP23467 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
PTPRBP23467 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
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PTPRBP23467 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
PTPRBP23467 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
PTPRBP23467 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
PTPRBP23467 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
PTPRBP23467 RNU4-85P-201ENST00000364675 123 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
PTPRBP23467 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.64□□□□□ -2.99
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PTPRBP23467 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
PTPRBP23467 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
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PTPRBP23467 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
PTPRBP23467 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
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