Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-4.25□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
BPTFQ12830 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
BPTFQ12830 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
BPTFQ12830 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
BPTFQ12830 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
BPTFQ12830 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
BPTFQ12830 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
BPTFQ12830 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
BPTFQ12830 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
BPTFQ12830 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-4.32□□□□□ -3.1
BPTFQ12830 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
BPTFQ12830 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
BPTFQ12830 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
BPTFQ12830 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-4.37□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
BPTFQ12830 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
BPTFQ12830 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
BPTFQ12830 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
BPTFQ12830 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
BPTFQ12830 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
BPTFQ12830 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
BPTFQ12830 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
BPTFQ12830 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
BPTFQ12830 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
BPTFQ12830 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
BPTFQ12830 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
BPTFQ12830 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
BPTFQ12830 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.12
BPTFQ12830 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-4.48□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-4.53□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
BPTFQ12830 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
BPTFQ12830 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
BPTFQ12830 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-4.54□□□□□ -3.14
BPTFQ12830 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
BPTFQ12830 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
BPTFQ12830 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
BPTFQ12830 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
BPTFQ12830 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
BPTFQ12830 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
BPTFQ12830 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
BPTFQ12830 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
BPTFQ12830 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
BPTFQ12830 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
BPTFQ12830 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
BPTFQ12830 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
BPTFQ12830 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
BPTFQ12830 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
BPTFQ12830 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
BPTFQ12830 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
BPTFQ12830 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
BPTFQ12830 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
BPTFQ12830 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
BPTFQ12830 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
BPTFQ12830 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-4.67□□□□□ -3.16
BPTFQ12830 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-4.67□□□□□ -3.16
BPTFQ12830 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
BPTFQ12830 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-4.68□□□□□ -3.16
BPTFQ12830 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC-4.7□□□□□ -3.16
BPTFQ12830 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
BPTFQ12830 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
BPTFQ12830 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
BPTFQ12830 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-4.71□□□□□ -3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.9 ms