Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-2.83□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
PTPRDP23468 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.89□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
PTPRDP23468 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
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PTPRDP23468 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
PTPRDP23468 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PTPRDP23468 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
PTPRDP23468 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
PTPRDP23468 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
PTPRDP23468 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
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PTPRDP23468 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PTPRDP23468 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PTPRDP23468 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PTPRDP23468 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PTPRDP23468 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
PTPRDP23468 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-2.95□□□□□ -2.88
PTPRDP23468 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
PTPRDP23468 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
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PTPRDP23468 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
PTPRDP23468 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
PTPRDP23468 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
PTPRDP23468 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
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PTPRDP23468 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
PTPRDP23468 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
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PTPRDP23468 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
PTPRDP23468 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
PTPRDP23468 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
PTPRDP23468 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
PTPRDP23468 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
PTPRDP23468 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
PTPRDP23468 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
PTPRDP23468 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
PTPRDP23468 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
PTPRDP23468 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-3.03□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
PTPRDP23468 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
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