Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
VAX2Q9UIW0 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAX2Q9UIW0 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172 ms