Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
SYCP1Q15431 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-3.1□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.13□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
SYCP1Q15431 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.2□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SYCP1Q15431 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SYCP1Q15431 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms