Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.47□□□□□ -2.64
SRSF6Q13247 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SRSF6Q13247 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 Y_RNA.658-201ENST00000515990 97 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
SRSF6Q13247 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SRSF6Q13247 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SRSF6Q13247 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SRSF6Q13247 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SRSF6Q13247 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SRSF6Q13247 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SRSF6Q13247 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SRSF6Q13247 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SRSF6Q13247 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SRSF6Q13247 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SRSF6Q13247 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SRSF6Q13247 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.7 ms