Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-4.31□□□□□ -3.1
CPSF1Q10570 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
CPSF1Q10570 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CPSF1Q10570 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-854P-201ENST00000364036 107 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CPSF1Q10570 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-4.52□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-4.53□□□□□ -3.13
CPSF1Q10570 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-4.55□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-4.56□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-4.57□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-4.58□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-4.59□□□□□ -3.14
CPSF1Q10570 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-4.6□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-4.61□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-4.62□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-4.63□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-4.64□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-4.65□□□□□ -3.15
CPSF1Q10570 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-4.66□□□□□ -3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.4 ms