Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SNRNP35Q16560 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SNRNP35Q16560 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SNRNP35Q16560 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
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