Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

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Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CACNA1EQ15878 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1EQ15878 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
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