Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-3.03□□□□□ -2.89
VAMP3Q15836 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-3.08□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
VAMP3Q15836 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-3.15□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-3.15□□□□□ -2.91
VAMP3Q15836 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
VAMP3Q15836 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
VAMP3Q15836 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
VAMP3Q15836 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.5 ms