Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
PTCH1Q13635 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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PTCH1Q13635 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTCH1Q13635 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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PTCH1Q13635 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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PTCH1Q13635 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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PTCH1Q13635 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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PTCH1Q13635 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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PTCH1Q13635 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
PTCH1Q13635 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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