Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
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