Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CHAF1BQ13112 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CHAF1BQ13112 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CHAF1BQ13112 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CHAF1BQ13112 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CHAF1BQ13112 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.5 ms