Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.7
PTPRBP23467 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.89□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PTPRBP23467 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PTPRBP23467 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PTPRBP23467 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.98□□□□□ -2.73
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