Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
PRRT1Q99946 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.41□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PRRT1Q99946 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PRRT1Q99946 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
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