Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KARSQ15046 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KARSQ15046 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KARSQ15046 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KARSQ15046 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KARSQ15046 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KARSQ15046 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KARSQ15046 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KARSQ15046 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KARSQ15046 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KARSQ15046 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KARSQ15046 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KARSQ15046 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
KARSQ15046 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KARSQ15046 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KARSQ15046 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KARSQ15046 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KARSQ15046 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KARSQ15046 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KARSQ15046 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KARSQ15046 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KARSQ15046 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KARSQ15046 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KARSQ15046 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KARSQ15046 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KARSQ15046 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
KARSQ15046 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
KARSQ15046 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KARSQ15046 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KARSQ15046 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
KARSQ15046 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
KARSQ15046 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
KARSQ15046 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
KARSQ15046 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
KARSQ15046 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
KARSQ15046 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
KARSQ15046 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
KARSQ15046 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
KARSQ15046 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
KARSQ15046 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
KARSQ15046 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
KARSQ15046 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
KARSQ15046 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
KARSQ15046 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
KARSQ15046 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
KARSQ15046 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
KARSQ15046 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
KARSQ15046 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
KARSQ15046 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
KARSQ15046 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
KARSQ15046 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
KARSQ15046 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
KARSQ15046 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
KARSQ15046 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
KARSQ15046 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
KARSQ15046 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
KARSQ15046 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
KARSQ15046 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KARSQ15046 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KARSQ15046 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KARSQ15046 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
KARSQ15046 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
KARSQ15046 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
KARSQ15046 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
KARSQ15046 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
KARSQ15046 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
KARSQ15046 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
KARSQ15046 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KARSQ15046 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KARSQ15046 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KARSQ15046 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
KARSQ15046 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KARSQ15046 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
KARSQ15046 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KARSQ15046 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KARSQ15046 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
KARSQ15046 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
KARSQ15046 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
KARSQ15046 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
KARSQ15046 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
KARSQ15046 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
KARSQ15046 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
KARSQ15046 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KARSQ15046 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KARSQ15046 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KARSQ15046 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
KARSQ15046 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KARSQ15046 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KARSQ15046 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
KARSQ15046 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KARSQ15046 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KARSQ15046 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KARSQ15046 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KARSQ15046 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KARSQ15046 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KARSQ15046 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KARSQ15046 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KARSQ15046 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KARSQ15046 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KARSQ15046 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194 ms