Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.33□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.62
CACNA1SQ13698 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
CACNA1SQ13698 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CACNA1SQ13698 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
CACNA1SQ13698 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
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