Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
HSPB3Q12988 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
HSPB3Q12988 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
HSPB3Q12988 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HSPB3Q12988 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
HSPB3Q12988 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
HSPB3Q12988 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HSPB3Q12988 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
HSPB3Q12988 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HSPB3Q12988 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
HSPB3Q12988 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HSPB3Q12988 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HSPB3Q12988 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
HSPB3Q12988 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HSPB3Q12988 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
HSPB3Q12988 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HSPB3Q12988 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HSPB3Q12988 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HSPB3Q12988 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HSPB3Q12988 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HSPB3Q12988 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HSPB3Q12988 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HSPB3Q12988 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HSPB3Q12988 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HSPB3Q12988 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.2 ms