Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
BPTFQ12830 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
BPTFQ12830 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.31□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 RNU6-627P-201ENST00000364032 102 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
BPTFQ12830 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-3.35□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
BPTFQ12830 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.9 ms