Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HOXC5Q00444 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.34□□□□□ -2.62
HOXC5Q00444 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
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HOXC5Q00444 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
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HOXC5Q00444 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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HOXC5Q00444 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HOXC5Q00444 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
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HOXC5Q00444 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
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HOXC5Q00444 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
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HOXC5Q00444 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
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HOXC5Q00444 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
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HOXC5Q00444 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HOXC5Q00444 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
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