Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HTATSF1O43719 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HTATSF1O43719 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
HTATSF1O43719 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
HTATSF1O43719 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.2 ms