Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NRXN1Q9ULB1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRXN1Q9ULB1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms