Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HDAC9Q9UKV0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HDAC9Q9UKV0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms