Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HACL1Q9UJ83 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACL1Q9UJ83 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms