Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP5Q9NZZ3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms