Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TAF1DQ9H5J8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms