Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 LHFPL3-AS1-202ENST00000416376 866 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 HVCN1-209ENST00000620084 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 DYNLT1-203ENST00000367089 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 MYL12A-207ENST00000579226 947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SENP3Q9H4L4 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC003991.1-203ENST00000591739 719 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SENP3Q9H4L4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms