Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
LTV1Q96GA3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LTV1Q96GA3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms