Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERCC4Q92889 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERCC4Q92889 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERCC4Q92889 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERCC4Q92889 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERCC4Q92889 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERCC4Q92889 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERCC4Q92889 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ERCC4Q92889 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERCC4Q92889 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERCC4Q92889 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERCC4Q92889 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERCC4Q92889 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms