Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HERVK_113Q902F9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms