Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC197Q8NCU1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms