Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms