Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CAPN12Q6ZSI9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms