Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTR9Q6PD62 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms