Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LMOD2Q6P5Q4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMOD2Q6P5Q4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms