Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EDC4Q6P2E9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EDC4Q6P2E9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.7 ms