Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF18Q5VWM3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms