Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EFCAB2Q5VUJ9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms