Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HES3Q5TGS1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms