Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC27A3Q5K4L6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC27A3Q5K4L6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms