Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms