Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP100Q494V2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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